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Sendo uma entidade com fins científicos e voltada para as ciências do mar, nossas áreas de atuação são todas ligadas ao meio ambiente, especialmente ao meio ambiente marinho, mas também às interfáces que esse faz com a atmosfera, os continentes e a criosfera (os continentes gelados).
Como forma de sujestão para os pesquisadores que elaboram e conduzem os projetos dentro da ATLANTIS, linhas de pesquisa foram eleitas como prioritárias, mas não exclusivas.
Linhas de Pesquisa dentro da Atlantis
1.Clima, Mudanças Globais, Aquecimento Global;
2.Processos Costeiros: erosão/deposição, transporte de sedimento, ondas, efluentes de dejetos domesticos e industriais, plumas de rios e dinâmica da região costeira;
3.Circulação Oceânica, circulação atmosférica, acoplamento circulações oceânica e atmosférica;
4.Processos Biológicos, Cadeias Tróficas Marinhas, Incorporação de Carbono pelos Oceanos, Balanço de Carbono no Planeta;
5.Educação Ambiental;
6.Poluição e Qualidade de Água;
7.Petróleo: estudo de impactos ambientais e simulação numérica da circulação oceânica para dar suporte a indústria do petróleo;
8.Gerenciamento de Recursos Vivos: recursos pesqueiros, aquicultura;
9.Ecologia dos ambientes marinho, estuarino e lacustre, e suas interfaces com o meio terrestre e a atmosfera.
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